
De acordo com o último censo demográfico 2022, das 505 cidades pertencentes à bacia em seis estados (Minas Gerais, Bahia, Pernambuco, Alagoas, Sergipe e Goiás) mais o Distrito Federal, apenas 41 municípios ultrapassam a marca de 90% no atendimento da população urbana com tratamento adequado de esgoto, abastecimento de água e acesso a banheiro em casa.
A maioria destes municípios se concentra no estado de Minas Gerais (36 cidades), as demais cidades estão na Bahia (02), Alagoas (01) e Sergipe (01), além de Brasília. A cidade mais avançada na universalização é Lagoa da Prata em Minas Gerais, seguida pela capital do Estado, Belo Horizonte que trata mais de 97% dos esgotos urbanos tratados.
Segundo o último censo (2022), enquanto, os melhores índices se concentram na região nascente do rio São Francisco, a situação não é a mesma a partir do estado baiano, onde dos 113 municípios pertencentes à bacia, apenas 28 deles tratam mais de 50% do esgoto, equivalente a 24,8%. Já a pior situação, segundo Censo, está no estado de Alagoas, na foz da bacia, onde somente 17,6% dos municípios da bacia tratam adequadamente o esgoto (9 de 51 municípios tratam mais de 50% do esgoto que cai no rio São Francisco).
Ainda Segundo o IBGE, a região do médio São Francisco detém a maior quantidade de municípios que tratam menos de 1% dos esgotos.
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